病原微生物检测 | 纳米磁珠助力mNGS
mNGS技术直接针对标本中核酸无偏倚检测病原微生物序列，提取的核酸及构建文库的质量是mNGS数据准确的关键要素。
01 儿童不明肝炎重症率达到10%
2022年4月以来，世卫组织（WHO）5个区域的33个国家向世卫组织报告了650例病因不明的儿童急性肝炎疑似病例，其中至少38例儿童需要进行移植，已向世卫组织报告了9例死亡（媒体公开信息报道）。不断增长的不明原因儿童肝炎病例数，时刻牵动着大家的心。目前，病因尚无定论，但在致病原因调查中，腺病毒和新冠病毒被认为有很大嫌疑。
02 mNGS是不明病原微生物分析重要手段
2022年4月23日WHO发布了针对不明原因儿童急性严重肝炎的诊断建议，但并无具体诊断和治疗方案意见。我国虽然尚无相关病例报告，国家重大公共卫生事件医学中心组织相关专家，根据已有的相关临床和实验室数据及新近国际儿童急性肝衰竭的处置流程或指南，编制了“不明原因儿童严重急性肝炎诊断和治疗专家建议”。 经普通临床检测仍无法明确诊断者，需要针对患者的血液、呼吸道分泌物、粪便、体液、肝穿组织等样本进行病原宏基因组二代测序（metagenomicnext generation sequencing，mNGS）。
mNGS技术直接针对标本中核酸无偏倚检测病原微生物序列，提取的核酸及构建文库的质量是mNGS数据准确的关键要素。mNGS检测流程基本包括标本采集、核酸提取、文库制备、上机测序、数据库比对、报告生成及结果解读等一系列过程（图1）。其中，核酸提取、PCR产物纯化、片段筛选过程都可以使用纳米磁珠实现高通量、快速和精准操作。
图1.mNGS检测流程图
03 样本处理是mNGS的关键步骤
mNGS检测具有独特的性质：a)可检测任意微生物，发现新的病原微生物; b）客观检测，不依赖假设；c)灵敏度极高，可定量检测核酸; d）可检测基因组的任一部分。因此，mNGS上机测序的核酸样本非常关键，确保无外源核酸的污染。
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撰稿人：王艳芝 | 修订：彭颖静
