BeaverBeads®蛋白纯化磁珠助力科学家揭示CRISPR-Cas系统适应阶段新机制
本研究利用His标签蛋白纯化磁珠,纯化带有His6- MBP标签的Cas1、Cas2、Cas4 三个蛋白,结合MBP Pull-down分析,揭示Cas1、Cas2、Cas4 三个蛋白间的互作关系。
应用简介:
本研究利用His标签蛋白纯化磁珠,纯化带有His6- MBP标签的Cas1、Cas2、Cas4 三个蛋白,结合MBP Pull-down分析,揭示Cas1、Cas2、Cas4 三个蛋白间的互作关系。
文献解析:
2021年2月22日,四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室陈强教授团队,在Nucleic Acids Research(IF=11.501)在线发表了标题为“Mechanisms of spacer acquisition by sequential assembly of the adaptation module in Synechocystis”的研究成果。该团队研究人员通过利用His标签蛋白纯化磁珠(BeaverBeads® IDA-Nickel cat. 70501),纯化带有His 6-MBP标签的Cas1、Cas2、Cas4 三个蛋白,结合MBP Pull-down(图1)分析及其他生物化学实验,揭示了Cas1、Cas2、Cas4 三个蛋白间的互作关系,并且解析了Cas1-Cas2-Spacer三元复合物的晶体结构(图2)和Cas1-Cas4二元复合物的电镜负染结构(图3),阐明了Cas4参与外源DNA捕获与整合的新机制。
图1.MBP pull-down 分析
图2.Cas1-Cas2-Spacer三元复合物结构
图3.Cas1-Cas4二元复合物结构
该团队认为,在I-D 型系统中, Cas4和Cas2会竞争性地与Cas1结合,可以形成 Cas1-Cas4和 Cas1-Cas2-Spacer 两种复合物,这两种复合物按次序先后参与间隔序列的整合。I-D型系统的间隔序列整合分为两个步骤:1)间隔序列的加工;2)间隔序列的整合。在此过程中,Cas1-Cas4复合物通过Cas4的PAM序列特异性的内切酶活性对间隔序列进行识别和加工,加工成熟的间隔序列又与Cas1、Cas2形成比Cas1-Cas4复合物更加稳定的Cas1-Cas2-Spacer复合物,将间隔序列插入到CRISPR位点,完成间隔序列的整合。
CRISPR-Cas基因编辑技术已经广泛应用于全球实验室,对CRISPR-Cas系统更加深入的了解不仅拓宽了人类的知识边界,还有助于开发更新一代的基因编辑工具。(部分内容来源于网络)
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